來源：藥師答疑解惑        時間：2022-07-19

       陸續(xù)推出系列MALDI-TOF MS的真真假假（僅涉及微生物方向，對于其他方向另議），供各位朋友交流，本交流僅代表個人觀點，與所在單位無關(guān)，僅供娛樂參考，如果您認(rèn)為有用，就轉(zhuǎn)發(fā)并關(guān)注公眾號，后續(xù)還有幾篇...... 

        第一篇：MALDI-TOF MS檢測的是蛋白嗎？(已發(fā)布，請在本公眾號中尋找原文) 

       簡介：已知的蛋白可以在MALDI-TOF質(zhì)譜上出峰，而未知樣品的MALDI-TOF質(zhì)譜峰不一定是蛋白峰，MALDI-TOF MS檢測微生物就是檢測未知樣本，因此MALDI-TOF MS檢測不一定是蛋白，更不是核糖體蛋白，是什么MALDI-TOF的技術(shù)做不到，僅知道是質(zhì)荷比。 

第二篇：通過得分就能判斷鑒定到種或鑒定到屬嗎？ 

        臨床微生物行業(yè)的圣經(jīng)級參考書CLSI M58，國內(nèi)多篇MALDI-TOF質(zhì)譜專家共識以及一些MALDI-TOF質(zhì)譜廠家的技術(shù)文件，一致認(rèn)為得分的高低可以判定鑒定到種水平或鑒定到屬水平或無法鑒定，要了解是否是真的，需要先知曉微生物質(zhì)譜建庫的模式，目前市面上流行的微生物建庫模式大概兩類： 

        第一：按照種比對建庫，不同來源的同一種菌（比如世界各地或全國各地不同實驗室的100株ECO），進(jìn)行質(zhì)譜圖采集（假設(shè)每一株菌采集20個峰圖，該種菌共計50株），再把所有峰圖（20*50=1000）疊加，后形成該種菌的標(biāo)準(zhǔn)譜圖或質(zhì)譜圖權(quán)重表，示例圖1，圖中形狀代表菌種，顏色代表不同來源的菌株，六角形這種菌數(shù)據(jù)庫譜圖是由10株不同來源六角形菌的譜圖擬合疊加而成。數(shù)據(jù)庫多少種菌就有多少個譜圖。 

       數(shù)據(jù)庫比對：一個未知峰圖與數(shù)據(jù)庫中每種菌的峰圖進(jìn)行比較，得出與該種屬菌的匹配性（一般用百分?jǐn)?shù)表示），見圖2。 

       第二：按照株比對建庫，一株菌采集不同多個峰圖（假設(shè)每一株菌采集20個峰圖），將這20個峰圖疊加形成該株菌的峰圖，示例圖3，5株六角形菌譜圖都在數(shù)據(jù)庫里，只有1株四角形菌，數(shù)據(jù)有多少株菌，就有多少個譜圖。比如某廠家質(zhì)譜宣傳數(shù)據(jù)庫能鑒定4000種，10000株，即平均每種菌只有2.5個菌株，估計有3000種以上的菌只有1株菌。 

      數(shù)據(jù)庫比對：一個未知峰圖與數(shù)據(jù)庫中每株菌的峰圖進(jìn)行比較，得出與該株菌的匹配性（一般用數(shù)字表示，不同質(zhì)譜廠家表現(xiàn)形式各異），見圖4。一般提示前十名或前二十名菌株信息。 

        綜上所述，不論哪一種比對算法，從得分上都不能確定鑒定到屬，得分僅能顯示所測菌的峰圖與建數(shù)據(jù)庫時該種菌或該株菌的峰圖匹配性。 

      第一種按種比對建庫還能確定到種，第二種只能到株，如果到種還需要進(jìn)一步運算。 

       第二種按株比對算法可能出現(xiàn)： 

       （1）前十名都在規(guī)定的分?jǐn)?shù)以上，但出現(xiàn)不同種屬時，需要對結(jié)果進(jìn)行復(fù)核測試。 

       （2）前十名都小于規(guī)定的分?jǐn)?shù)，但出現(xiàn)同一種菌時，其結(jié)果也可能是對的，只不過該菌譜圖與建庫菌的譜圖匹配性略低。 

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