來(lái)源:科技日?qǐng)?bào) 時(shí)間:2020-10-28
新算法檢測(cè)合并樣本 即可大規(guī)模篩查
早期識(shí)別新冠肺炎患者費(fèi)用比單獨(dú)檢測(cè)便宜20倍
科技日?qǐng)?bào)北京10月22日電 (記者張夢(mèng)然)英國(guó)《自然》雜志22日發(fā)表一項(xiàng)傳染性疾病相關(guān)研究,科學(xué)家團(tuán)隊(duì)報(bào)告一種利用少量檢測(cè)對(duì)大量人口進(jìn)行新冠病毒感染篩查的數(shù)學(xué)方法。這種方法非常適合于大規(guī)模監(jiān)測(cè)感染情況,與此同時(shí),其有助于降低大規(guī)模檢測(cè)費(fèi)用,在無(wú)法負(fù)擔(dān)大量檢測(cè)的低收入國(guó)家可能特別有益。
快速識(shí)別和隔離新冠病毒感染者是控制該病毒傳播的重要策略。檢測(cè)病毒RNA的PCR檢測(cè)非常準(zhǔn)確,但每次檢測(cè)費(fèi)用約為30美元至50美元。對(duì)于低收入國(guó)家來(lái)說(shuō),這些費(fèi)用尤其具有挑戰(zhàn)性。
合并(或集中)樣本一起檢測(cè),可以提高分析效率,降低成本。當(dāng)某疾病在人群中的發(fā)病率較低,且大多數(shù)檢測(cè)結(jié)果為陰性時(shí),這種方法尤其有效。標(biāo)準(zhǔn)的分組檢測(cè)程序是在檢測(cè)前將樣本合并成一定規(guī)模的小組。如果一組檢測(cè)結(jié)果為陽(yáng)性,則對(duì)該組中的樣本逐一進(jìn)行檢測(cè),以確定陽(yáng)性個(gè)體。
加拿大圓周理論物理研究所科學(xué)家維爾弗雷德·恩迪馮、尼爾·塔洛克及他們的同事,此次提出了一種數(shù)學(xué)算法,通過(guò)使用合并的平行PCR檢測(cè)來(lái)優(yōu)化新冠病毒感染的篩查。該方法的基礎(chǔ)是將一組樣本分成多個(gè)子樣本,并將它們重新組合,使其仿佛處于一個(gè)高維立方體中一樣。如果有一個(gè)樣本新冠病毒檢測(cè)呈陽(yáng)性,那么立方體上對(duì)應(yīng)陽(yáng)性池的坐標(biāo)就會(huì)立即把它識(shí)別出來(lái)。否則,隨著使用算法對(duì)子樣本進(jìn)行重新排列,可能需要進(jìn)行額外的檢測(cè)。子樣本組的大小可以優(yōu)化;隨著流行率的降低,子組可以變大,以確保通常只需要的兩輪檢測(cè)。
該方法要求在組內(nèi)合并子樣本時(shí),仍可有效檢測(cè)稀釋樣本中的新冠病毒??茖W(xué)家團(tuán)隊(duì)利用在盧旺達(dá)新冠肺炎監(jiān)測(cè)期間收集的樣本,證明了當(dāng)一個(gè)陽(yáng)性樣本與99個(gè)陰性樣本混合時(shí),仍然可以將新冠病毒檢測(cè)出來(lái)。他們總結(jié)說(shuō),該算法有望使早期識(shí)別感染者的費(fèi)用比單獨(dú)檢測(cè)便宜20倍。