來源:中華檢驗醫(yī)學(xué)網(wǎng) 時間:2020-06-10
引起人類疾病的病原微生物種類繁多。不同微生物菌株會導(dǎo)致不同程度的疾病,從普通感冒到可能危及生命的感染,如結(jié)核病(TB)。類似地,不同菌株對抗菌藥物的敏感性不同,有些菌株對多種藥物完全耐藥,有些菌株具有中等敏感性,有些菌株則對治療完全敏感。
抗生素耐藥性對全球健康構(gòu)成了嚴(yán)重威脅,并給全球醫(yī)療體系帶來巨大負(fù)擔(dān)。例如,耐多藥結(jié)核病(MDR-TB)仍然是公共衛(wèi)生危機和健康安全威脅,特別是在印度、印度尼西亞和中國等國。據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)估計,2017年,有558000例對利福平(最有效的一線藥物)耐藥的新病例,其中457560例是耐多藥結(jié)核病[1]。微生物通常會進化成新的菌株,因此人們正在尋找并開發(fā)出與之抗衡的新療法,以及檢測患者樣本中微生物的創(chuàng)新技術(shù)。
新漢諾威地區(qū)醫(yī)療中心(NHRMC)是北卡羅來納州威爾明頓的一家社區(qū)醫(yī)院,它配有技術(shù)領(lǐng)先的微生物學(xué)實驗室用于微生物鑒定(ID)。實驗室已投資最先進的儀器,以確保其臨床醫(yī)生能夠盡快提供最合適的治療方法,以幫助抵抗抗生素耐藥性。
轉(zhuǎn)向質(zhì)譜
許多微生物學(xué)實驗室依賴傳統(tǒng)的生化和培養(yǎng)技術(shù)來進行微生物鑒定,這阻礙了臨床醫(yī)生獲取結(jié)果的速度。例如,在NHRMC,使用傳統(tǒng)方法進行一次鑒定可能需要2到3天,而抗生素敏感性測試(AST)則可能需要五天。營養(yǎng)要求復(fù)雜的、生長緩慢的、無法存活或不可培養(yǎng)的微生物也很難用這些方法進行鑒定,其中許多必須送到參考實驗室進行進一步的研究。
2016年基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜(MALDI-TOF MS)技術(shù)被引入NHRMC,極大地縮短了微生物鑒定的周轉(zhuǎn)時間(TAT)。在檢驗中,質(zhì)譜的鑒定率約為96%,高于傳統(tǒng)的生化方法(僅為82%)。此外,生化方法需要更長的時間,而且常常需要重新測試。在此期間,臨床醫(yī)生經(jīng)常給患者使用廣譜抗生素用以預(yù)防,這不僅成本高昂,而且會導(dǎo)致耐藥性的蔓延。
基于蛋白質(zhì)指紋技術(shù),MALDI-TOF質(zhì)譜被用于細(xì)菌和酵母菌的分類與鑒定。專門的質(zhì)譜儀可以測量在所有微生物中都存在的高豐富蛋白質(zhì)。獲得的蛋白質(zhì)特征譜圖通過與經(jīng)FDA批準(zhǔn)的涵蓋厭氧菌、革蘭陽性細(xì)菌、革蘭陰性細(xì)菌以及酵母等在內(nèi)的333個不同群425種微生物的數(shù)據(jù)庫進行比對,從而得到可靠、準(zhǔn)確的微生物鑒定結(jié)果。
轉(zhuǎn)變對患者的護理
引入MALDI-TOF 質(zhì)譜后,微生物鑒定的時間從3-5天縮短到1-2天。微生物學(xué)實驗室不久后就實現(xiàn)了全自動化,從而進一步縮短了測試時間。這使得次日即可完成微生物鑒定,加快了確診時間,并使臨床醫(yī)生能夠更早地對患者采取針對性的治療方案。表1顯示了NHRMC在五種生物鑒定上所節(jié)省的時間。
MALDI-TOF質(zhì)譜的引入和對臨床重要微生物近乎實時的鑒定,可以更積極地促進抗生素管理,降低MDR的發(fā)生率,以及迅速采取正確的感染控制措施。
MALDI-TOF 質(zhì)譜法不僅鑒定結(jié)果準(zhǔn)確可靠和周轉(zhuǎn)時間短,還能鑒定以前使用傳統(tǒng)微生物學(xué)方法無法鑒定的微生物。例如,某些患者接受牙科手術(shù)后發(fā)展為術(shù)后口腔感染。因為許多傳統(tǒng)的生化鑒定板不包括口腔細(xì)菌,所以導(dǎo)致口腔感染的微生物很難得到鑒定。該實驗室現(xiàn)在可以確定由口腔感染導(dǎo)致的敗血癥,而在過去,則會被送到參考實驗室,從而導(dǎo)致針對性抗生素治療的嚴(yán)重延遲。
成本節(jié)約
向質(zhì)譜和自動化轉(zhuǎn)變的主要推動力之一是可以大大節(jié)省在鑒定和藥敏試驗方面的費用。自從引入MALDI-TOF 質(zhì)譜以來,實驗室已經(jīng)取得了一些顯著結(jié)果??股刂委煹姆秶s小到60%的患者中,僅通過更快地提供明確的鑒定結(jié)果并逐步降低或停止使用抗生素即可節(jié)省200,000美元。
進行生化測試的總成本也降低了。在使用MALDI-TOF 質(zhì)譜的第一年,醫(yī)院的輔助檢驗成本降低了約100,000美元,并將技術(shù)人員的管理工作減少了約70%。預(yù)計下一年實驗室試劑的輔助成本將再減少30,000-40,000美元。
MALDI-TOF 質(zhì)譜的準(zhǔn)確鑒定也節(jié)省了可觀的成本。使用該系統(tǒng)的鑒定成本約為1.90美元,而以前的生化鑒定方法成本則為8.57美元,即每個樣本的鑒定節(jié)省6.67美元。
案例
最重要的是,MALDI-TOF 質(zhì)譜對NHRMC的患者的恢復(fù)結(jié)果產(chǎn)生了直接影響。有位21歲的男性患者,因發(fā)燒和頭痛到急診室就診。他患有格雷夫斯?。ㄒ环N影響甲狀腺的自身免疫性疾?。┖透哐獕翰∈罚珶o其它突出的健康問題。
患者入院后,實驗室收集血培養(yǎng)、尿液分析、化學(xué)和血液學(xué)資料。腦膜炎組和其它實驗室檢查均呈陰性,入院后20小時血培養(yǎng)呈陽性(均為厭氧瓶)。革蘭染色呈革蘭陰性細(xì)長棒狀,并在兩天內(nèi)進行繼代培養(yǎng)。第二天,醫(yī)生要求查看培養(yǎng)物,培養(yǎng)物在18小時(入院后38小時)出現(xiàn)有氧生長。
MALDI-TOF 質(zhì)譜鑒定發(fā)現(xiàn)該生物為壞死梭桿菌,它是萊米爾綜合征的致病菌,可導(dǎo)致敗血癥等嚴(yán)重并發(fā)癥。結(jié)果立即通知醫(yī)生,病人改服頭孢曲松和甲硝唑,劑量高于標(biāo)準(zhǔn)計量。病人入院后已服用頭孢曲松,但劑量要低得多。在治療方案改變后的6小時內(nèi),患者反應(yīng)良好,并在入院44小時后從重癥監(jiān)護室(ICU)轉(zhuǎn)移到普通病房。如果沒有這種更快速的鑒定,治療方案的改變可能會慢得多,可能導(dǎo)致患者在重癥監(jiān)護室(ICU)停留更久、住院時間更長,臨床結(jié)果也可能很糟糕。
未來的傳染病治療
MALDI-TOF質(zhì)譜之類的先進技術(shù)的應(yīng)用,為研究人員和醫(yī)療保健提供者提供了有力工具,幫助他們與最具挑戰(zhàn)性的病原體作斗爭。如果沒有確定的感染性微生物的鑒定結(jié)果,臨床醫(yī)生只能提供廣譜抗菌藥物,這種治療策略不僅昂貴,而且還對抗生素耐藥性的傳播造成更高的風(fēng)險。通過在更短的時間內(nèi)告知臨床醫(yī)生確切的鑒定結(jié)果,可以更快地對患者使用特定的、有針對性的抗生素,從而節(jié)省成本、縮短住院時間,還有助于抵抗持續(xù)存在的MDR威脅。