來源:中國(guó)科學(xué)院微生物研究所 時(shí)間:2022-10-27
近日,真菌學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、國(guó)家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心(NMDC)在《核酸研究》上聯(lián)合發(fā)表文章,系統(tǒng)介紹了世界三大菌物名稱注冊(cè)庫(kù)之一的Fungal Names(FN,https://nmdc.cn/fungalnames/)。
菌物分類學(xué)是一門快速發(fā)展與不斷變化的學(xué)科。地球上潛在菌物種類達(dá)220-380萬種,而已描述并正式命名的物種不到7%。因此發(fā)現(xiàn)菌物新分類單元并進(jìn)行正確命名對(duì)菌物分類學(xué)發(fā)展及菌物相關(guān)研究與應(yīng)用尤為重要。建成一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)化的、符合《藻類、真菌和植物國(guó)際命名法規(guī)范》的菌物名稱注冊(cè)平臺(tái)將成為真菌分類學(xué)研究的有效助力。Fungal Names是由國(guó)際菌物命名委員會(huì)(NCF)授權(quán)的三個(gè)菌物命名注冊(cè)庫(kù)之一,能為全球?qū)W者快速發(fā)表真菌名稱提供注冊(cè),并用于文章發(fā)表。目前已收錄1596年以來出版的1萬多部期刊和書籍中的56.7萬個(gè)分類單元名稱,以及超過5千個(gè)保藏機(jī)構(gòu)的14.7萬份模式標(biāo)本/插圖記錄。FN同時(shí)還是一個(gè)綜合性菌物知識(shí)信息庫(kù),它將菌物命名信息與標(biāo)本、保藏機(jī)構(gòu)、出版物和分類學(xué)家進(jìn)行整合,為學(xué)者提供了多源、多角度信息來了解菌物分類學(xué)歷史和最新研究進(jìn)展。
文章稱,F(xiàn)ungal Names搭載的菌物名稱數(shù)據(jù)庫(kù)收錄了跨越400多年的菌物名稱及分類學(xué)信息記錄。在所有567354條記錄中,包含535450條(94.4%)物種或種下單元數(shù)據(jù)和其余的高等級(jí)分類單元數(shù)據(jù)(如綱、目、科等)。按照名稱類型統(tǒng)計(jì),338 955個(gè)(60.0%)為新分類單元名稱、182289個(gè)(32.1%)是新組合名稱、7735個(gè)(1.4%)是新命名、35234個(gè)(6.2%)是變體名稱,剩余3141個(gè)(0.6%)為不確定名稱。
該文章還統(tǒng)計(jì)了有史以來菌物名稱、作者、模式標(biāo)本、模式標(biāo)定數(shù)量隨著時(shí)間的變化趨勢(shì),發(fā)現(xiàn)菌物名稱發(fā)表數(shù)量可能與分類學(xué)家數(shù)量、重要?dú)v史事件(2次世界大戰(zhàn))、DNA條形碼技術(shù)的發(fā)展等相關(guān)。
基因組學(xué)時(shí)代,F(xiàn)ungal Names將進(jìn)一步對(duì)已有系統(tǒng)進(jìn)行更新并搭載新的功能,以適應(yīng)不斷變化的菌物命名規(guī)則并全方位的整合菌物相關(guān)的數(shù)據(jù)信息。
全文鏈接:https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkac926/6769758
【來源:摘自中國(guó)科學(xué)院微生物研究所】
聲明:轉(zhuǎn)載此文是出于傳遞更多信息之目的。若有來源標(biāo)注錯(cuò)誤或侵犯了您的合法權(quán)益,請(qǐng)作者持權(quán)屬證明與本網(wǎng)聯(lián)系,我們將及時(shí)更正、刪除,謝謝。 郵箱地址:xlg@xhpr.net